Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms