Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms