Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Timd4Q6U7R4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms