Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms