Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms