Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gramd2bQ6PEM6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gramd2bQ6PEM6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms