Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc85bQ6PDY0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms