Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms