Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp49Q6P9L4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms