Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms