Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms