Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp140Q6NSQ5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp140Q6NSQ5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp140Q6NSQ5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp140Q6NSQ5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp140Q6NSQ5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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