Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms