Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms