Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno1Q689Z5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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Sbno1Q689Z5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbno1Q689Z5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms