Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2bQ64511 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms