Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab34Q64008 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab34Q64008 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms