Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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