Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnrpcQ62241 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms