Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms