Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms