Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxj1Q61660 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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