Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamb3Q61087 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms