Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms