Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurod1Q60867 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms