Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot7Q60809 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms