Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb6Q60692 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.3 ms