Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CttnQ60598 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms