Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms