Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tsr1Q5SWD9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms