Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim41Q5NCC3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms