Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf2Q59J78 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms