Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eme2Q56A04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms