Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms