Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms