Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrrc43Q3V0L5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrrc43Q3V0L5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrrc43Q3V0L5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrrc43Q3V0L5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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