Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3V0E1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3V0E1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms