Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms