Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Obox3Q3UT54 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Obox3Q3UT54 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms