Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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