Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms