Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp3Q3ULW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms