Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BtrcQ3ULA2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BtrcQ3ULA2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms