Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UJP5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms