Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21748Q3UE70 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21748Q3UE70 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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