Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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