Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms