Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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