Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms