Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rnf40Q3U319 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rnf40Q3U319 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rnf40Q3U319 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rnf40Q3U319 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf40Q3U319 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf40Q3U319 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms